Αμιδάση (AMD)
Ένζυμα:Είναι μακρομοριακοί βιολογικοί καταλύτες, τα περισσότερα ένζυμα είναι πρωτεΐνες
Αμιδάση:Καταλύστε την υδρόλυση διαφόρων ενδογενών και ξένων αλειφατικών και αρωματικών αμιδίων με μεταφορά μιας ακυλομάδας στο νερό με την παραγωγή ελεύθερων οξέων και αμμωνίας.Τα υδροξαμικά οξέα και άλλα οργανικά οξέα χρησιμοποιούνται ευρέως ως φάρμακα επειδή είναι συστατικά αυξητικών παραγόντων, αντιβιοτικών και αναστολέων όγκου.Οι αμιδάσες μπορούν να χωριστούν σε ακυλάσες τύπου R και τύπου S σύμφωνα με τη στερεοεκλεκτικότητα του καταλύτη.
Εκτός από την κατάλυση της υδρόλυσης των αμιδίων, η αμιδάση μπορεί επίσης να καταλύσει αντιδράσεις μεταφοράς ακυλίου παρουσία συν-υποστρωμάτων όπως η υδροξυλαμίνη.
Η αμιδάση με διαφορετικές πηγές έχει διαφορετική εξειδίκευση υποστρώματος, μερικά από αυτά μπορούν να υδρολύσουν μόνο αρωματικά αμίδια, μερικά από αυτά μπορούν μόνο να υδρολύσουν αλειφατικά αμίδια και μερικά να υδρολύσουν α- ή ω-αμινο αμίδια.Οι περισσότερες από τις αμίνες έχουν καλή καταλυτική δράση μόνο για άκυκλα ή απλά αρωματικά αμίδια, αλλά για σύνθετα αρωματικά, τα ετεροκυκλικά αμίδια, ειδικά τα αμίδια με ορθο-υποκαταστάτες, είναι γενικά χαμηλής δράσης (μόνο λίγα ένζυμα παρουσιάζουν καλύτερα καταλυτικά αποτελέσματα).
Καταλυτικός μηχανισμός:
Ένζυμα | Κωδικός προϊόντος | Κωδικός προϊόντος |
Ενζυμική σκόνη | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | ένα σετ 19 αμιδασών, 50 mg το καθένα 19 είδη * 50 mg / τεμάχιο, ή άλλη ποσότητα |
Screening Kit (SynKit) | ES-AMD-1900 | ένα σετ 19 αμιδασών, 1 mg το καθένα 19 είδη * 1 mg / τεμάχιο |
★ Υψηλή ειδικότητα υποστρώματος.
★ Ισχυρή χειρόμορφη επιλεκτικότητα.
★ Υψηλή απόδοση μετατροπής.
★ Λιγότερα υποπροϊόντα.
★ Ήπιες συνθήκες αντίδρασης.
★ Φιλικό προς το περιβάλλον.
➢ Θα πρέπει να πραγματοποιείται έλεγχος ενζύμων για συγκεκριμένα υποστρώματα λόγω της ειδικότητας του υποστρώματος και να λαμβάνεται ένα ένζυμο που καταλύει το υπόστρωμα στόχο με το καλύτερο καταλυτικό αποτέλεσμα.
➢ Ποτέ μην έρθετε σε επαφή με ακραίες συνθήκες όπως: υψηλή θερμοκρασία, υψηλό/χαμηλό pH και οργανικός διαλύτης με υψηλή συγκέντρωση.
➢ Κανονικά, το σύστημα αντίδρασης πρέπει να περιλαμβάνει υπόστρωμα, ρυθμιστικό διάλυμα (Το βέλτιστο pH αντίδρασης του ενζύμου).Στο σύστημα αντίδρασης μεταφοράς ακυλίου θα πρέπει να υπάρχουν συν-υποστρώματα όπως η υδροξυλαμίνη.
➢ Η AMD πρέπει να προστεθεί τελευταία στο σύστημα αντίδρασης με βέλτιστο pH αντίδρασης και θερμοκρασία.
➢ Όλα τα είδη AMD έχουν διάφορες βέλτιστες συνθήκες αντίδρασης, επομένως καθένα από αυτά θα πρέπει να μελετηθεί περαιτέρω ξεχωριστά.
Παράδειγμα 1(1):
Δραστηριότητα υδρόλυσης σε διαφορετικά υποστρώματα αμιδίου
Υπόστρωμα | Συγκεκριμένη δραστηριότητα μmol min-1mg-1 | Υπόστρωμα | Συγκεκριμένη δραστηριότητα μmol min-1mg-1 |
Ακεταμίδιο | 3.8 | ο-ΟΗ βενζαμίδιο | 1.4 |
Προπιοναμίδη | 3.9 | p-ΟΗ βενζαμίδιο | 1.2 |
Λακταμίδη | 12.8 | ο-ΝΗ2βενζαμίδη | 1.0 |
Βουτυραμίδιο | 11.9 | p-ΝΗ2βενζαμίδη | 0,8 |
Ισοβουτυραμίδη | 26.2 | ο-Τολουαμίδιο | 0.3 |
Πενταναμίδη | 22.0 | p-Τολουαμίδιο | 8.1 |
Εξαναμίδιο | 6.4 | Νικοτιναμίδη | 1.7 |
Κυκλοεξαναμίδη | 19.5 | Ισονικοτιναμίδη | 1.8 |
Ακρυλαμίδιο | 10.2 | Πικολιναμίδη | 2.1 |
Μετακρυλαμίδιο | 3.5 | 3-Φαινυλοπροπιοναμίδιο | 7.6 |
Προλιναμίδη | 3.4 | Ινδολ-3-ακεταμίδιο | 1.9 |
Βενζαμίδη | 6.8 |
Η αντίδραση διεξήχθη σε ρυθμιστικό διάλυμα φωσφορικού νατρίου 50 mM, ρΗ 7,5, στους 70 ℃.
Αμίδια | Υδροξυλαμίνη | Υδραζίνη |
Ακεταμίδιο | 8.4 | 1.4 |
Προπιοναμίδη | 18.4 | 3.0 |
Ισοβουτυραμίδη | 25.0 | 22.7 |
Βενζαμίδη | 9.2 | 6.1 |
Η αντίδραση διεξήχθη σε ρυθμιστικό διάλυμα φωσφορικού νατρίου 50 mM, ρΗ 7,5, στους 70 ℃.
Σχετική συγκέντρωση αντιδραστηρίου: αμίδια, 100 mM (βενζαμίδιο, 10 mM);υδροξυλαμίνη και υδραζίνη, 400 mM;ένζυμο 0,9 μΜ.
Παράδειγμα 2(2):
Παράδειγμα 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, et al.Process Biochemistry, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, et αϊ.Bioorganic Chemistry, 2017, Διαθέσιμο στο διαδίκτυο 7.